根據(jù)急性發(fā)熱起病，口腔有丘疹水皰性損害及培養(yǎng)出柯薩奇或埃可病毒，即可診斷。它與一些口腔有水皰的病毒性疾病鑒別。實(shí)驗(yàn)室檢查白細(xì)胞增高，取咽部皰液或大便，經(jīng)組織培養(yǎng)或接種于乳鼠可得致病病毒，同時(shí)可取急性期及恢復(fù)期血清進(jìn)行特殊的中和抗體、補(bǔ)體結(jié)合或血凝抑制試驗(yàn)，以助確診。
可根據(jù)癥狀和特征性口腔損害作出診斷。最好通過從損害處分離到病毒或通過特征性抗體滴度升高加以證實(shí)，但這些檢查并不推薦常規(guī)采用。鑒別診斷包括皰疹性口腔炎(特點(diǎn)為任何季節(jié)均可發(fā)病，呈現(xiàn)更大的，持續(xù)更久的潰瘍)，復(fù)發(fā)性口瘡和Bednar口瘡(很少發(fā)生于咽部，而已一般無全身癥狀)。柯薩奇A組10型病毒也會(huì)引起類似病變(淋巴結(jié)性咽炎)，但口咽部損害突出，呈現(xiàn)白色到黃色小結(jié)。治療為對(duì)癥處理。